تأسست أمانة مجلس الجامعة بالقرار المرقم 173 في 20/9/1999م مع تأسيس رئاسة جامعة ديالى ، وهي مرتبطة بمكتب السيد رئيس الجامعة مباشرة ، يرأسها موظف بعنوان (أمين مجلس الجامعة) ويقوم بما يكلفه السيد رئيس الجامعة بالإضافة إلى مهامه سواء بتقديم الاستشارات والدراسات وإبداء الرأي في مختلف شؤون الجامعة وأقسامها وكلياتها، وهي الدائرة المعنية باجتماعات أمانة مجلس الجامعة والمكونة من عمداء الكليات ،وتقوم بتنظيم عقد هذه الاجتماعات وتوثيق محاضرها تباعاً ،وكما تقوم بالإجراءات والمهام الآتية: 1. توثيق محاضر مجالس الكليات كافة ،وتهيئة المصادقات على توصياتها وقراراتها واستحصال موافقة السيد رئيس الجامعة عليها وإحالة الموضوعات التي تحتاج إلى دراسة وإبداء رأي مجلس الجامعة فيها إلى الأقسام المعنية في الجامعة. 2. إبلاغ الكليات بالمصادقة على محاضر مجالسها لتبدأ بتنفيذ ما تم إقراره والمصادقة عليه. 3. تهيئة جدول أعمال اجتماع مجلس الجامعة والذي تتم مناقشة مواده وفقراته أثناء انعقاد اجتماع مجلس الجامعة
